Lietuvos Respublikos apmokestinamieji asmenys, vykdantys bet kokio pobūdžio ekonominę veiklą, privalo pateikti prašymą įsiregistruoti PVM mokėtoju, kai:

- Lietuvoje tiekia prekes ir/ar teikia paslaugas ir bendra per metus (per paskutinius 12 mėnesių) gauto atlygio suma yra didesnė kaip 45 000 eurų;- tie patys asmenys (vieni ar kartu su kitais asmenimis) kontroliuoja keletą juridinių asmenų ir visų jų kontroliuojamų juridinių asmenų ir jų pačių bendra gauta ar gautina atlygio už, vykdant ekonominę veiklą, patiektas prekes ir/ar paslaugas suma per metus (per paskutinius 12 mėnesių) viršijo 45 000 eurų sumą, neatsižvelgiant į tai, kad kiekvieno tokio asmens ar dalies jų gauto ar gautino atlygio suma yra mažesnė už nustatytą 45 000 eurų sumą. Užsienio valstybės asmenys (asmenys iš kitos valstybės narės ir iš teritorijos, kuri nėra Europos Sąjungos teritorija) privalo Lietuvoje registruotis PVM mokėtoju nuo pat ekonominės veiklos pradžios (t. y. neatsižvelgiant į 45 000 eurų atlygio ribą), jeigu jis tiekia prekes ir/ar teikia paslaugas (tiekimo vieta yra šalies teritorija), išskyrus atvejus, kai prekės ir/ar paslaugos nėra apmokestinamos PVM arba joms taikomas 0 % PVM tarifas. Asmenys (Lietuvos Respublikos ir užsienio apmokestinamieji asmenys, kurie vykdo ekonominę veiklą, ūkininkai, kuriems taikoma kompensacinio PVM tarifo schema, ir juridiniai asmenys, kurie nėra apmokestinamieji asmenys), kurie neprivalo būti ir (arba) nėra įregistruoti PVM mokėtojais, Lietuvoje iš kitų ES valstybių narių įsigyja prekių (kitokių nei naujos transporto priemonės ar akcizais apmokestinamos prekės), kurių vertė praėjusiais kalendoriniais metais buvo didesnė kaip 14 000 eurų, ir einamaisiais kalendoriniais metais numatoma, kad tokių prekių vertė bus didesnė kaip 14 000 eurų. Užsienio asmenys, vykdantys nuotolinę prekybą, privalo registruotis PVM mokėtojais, jeigu tiekiamų į Lietuvos Respubliką atgabentų prekių vertė (neįskaitant PVM sumokėto kitoje valstybėje narėje) per praėjusius kalendorinius metus viršija arba einamaisiais kalendoriniais metais viršijo 35 000 eurų. Atkreiptinas dėmesys, kad prievolė registruotis PVM mokėtojais dėl nuotolinės prekybos atsiranda tuomet, kai atgabentų į Lietuvos Respubliką prekių vertė (neįskaitant PVM sumokėto kitoje valstybėje narėje) viršijo 35 000 eurų (akcizais apmokestinamų prekių tiekimo atveju ši riba netaikoma). PVM mokėtojais gali būti registruojami tik Mokesčių mokėtojų registre įregistruoti asmenys. Pasikeitus asmens kontroliuojamų asmenų ir jį kontroliuojančių asmenų duomenims, Lietuvos ar užsienio valstybių asmenys turi pateikti prašymą su patikslintais duomenimis.

Lietuvos asmenys turi teisę pateikti Prašymą išregistruoti iš PVM mokėtojų, kai: - bendra jo gauto atlygio už, vykdant ekonominę veiklą, šalies teritorijoje patiektas prekes ir/ar suteiktas paslaugas suma per metus (per paskutinius 12 mėnesių) yra mažesnė kaip 45 000 eurų; - pabaigia veiklą dėl likvidavimo arba reorganizavimo; - nevykdo ekonominės veiklos; - iš kitų valstybių narių įsigytų prekių vertė praėjusiais kalendoriniais metais neviršijo ir einamaisiais kalendoriniais metais nenumato viršyti 35 000 eurų; - išsiregistravus neatsiranda prievolė įsiregistruoti PVM mokėtoju. Užsienio asmenys gali išsiregistruoti iš PVM mokėtojų, kai: - Lietuvoje nutraukia veiklą; - praėjusiais kalendoriniais metais į Lietuvą atgabentų visų prekių vertė neviršijo ir einamaisiais kalendoriniais metais nenumato viršyti 35 000 eurų (jei užsienio asmuo PVM mokėtoju buvo įregistruotas dėl nuotolinės prekybos); - pabaigia veiklą dėl likvidavimo arba reorganizavimo; - išsiregistravus neatsiranda prievolė įsiregistruoti PVM mokėtoju. PVM mokėtojai gali būti išregistruojami mokesčių administratorius iniciatyva, kai: - nevykdo ekonominės veiklos ir (ar) prekių įsigijimų iš kitų valstybių narių; - pabaigia veiklą dėl likvidavimo arba reorganizavimo; - yra mirę arba paskelbti mirusiais (fiziniai asmenys).

PVM mokėtojai, gali susigrąžinti sumokėtą PVM už kitose valstybėse įsigytas įvairias prekes bei paslaugas. Tam tikslui išduodamas ūkio subjekto įregistravimą PVM mokėtoju Lietuvoje patvirtinantis sertifikatas, kuris galioja vienerius kalendorinius metus.